换一批利用Indel标记鉴定太白贝母及其近缘种
Molecular Identification of Fritillaria taipaiensis and Its Relatives Based on Indel Marker
摘要目的 建立基于插入缺失(Indel)标记的常规聚合酶链反应(PCR)方法对太白贝母及其近缘种开展分子鉴定研究.方法 从GenBank下载103条来自不同贝母来源植物的叶绿体基因组序列,序列比对筛选太白贝母的特异性Indel标记.在该Indel标记的上下游保守区中设计引物,通过常规PCR与凝胶电泳方法对不同贝母来源植物开展鉴定,并考察方法的特异性、灵敏性与最适反应温度.结果 太白贝母在accD-psal基因间隔区具有一段长度为137 bp的缺失,可以作为太白贝母的特异性Indel标记.建立的常规PCR与凝胶电泳方法对太白贝母有良好的特异性,仅有太白贝母产生302 bp的条带,从而与暗紫贝母等其余12种不同贝母来源植物明显区分.该方法对贝母DNA模板的检测下限为0.239 ng·μL-1,最适熔解温度(Tm)值为58℃.结论 该检测方法具有特异性高、快捷与成本低等特点,不仅能够实现对太白贝母及其近缘种的准确鉴定,还能够为其他重要来源植物的分子鉴定提供开发思路.
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关键词
叶绿体基因组太白贝母accD-psaI插入缺失标记分子鉴定chloroplast genomeFritillaria taipaiensisaccD-psaIIndel markermolecular identification
分类号
R282（中药学）
栏目名称
DOI
10.11669/cpj.2024.15.005
发布时间
2024-10-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
四川省科技项目（2018SZ0061）
四川省科技项目（2021ZHFP0170）
四川省中医药管理局面上项目（2021MS116）
成都市科技局项目（2022-YF05-01357-SN）
西南交通大学医工结合项目（2682021ZTPY017）
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