换一批LncRNA LBX2-AS1在结肠癌中生物信息学分析及初步验证
Bioinformatics analysis and preliminary verification of IncRNA LBX2-AS1 in colon cancer
摘要目的 基于生物信息学角度探讨长链非编码RNA(LncRNA)LBX2反义RNA1(LBX2-AS1)对结肠癌预后的影响并进行初步验证.方法 在基因表达交互分析(GEPIA)数据库查找并明确与结肠癌预后密切相关的基因LBX2-AS1,在UCSCxena数据库中下载结肠癌数据集(TCGA-COAD)及生存信息,并分为LBX2-AS1高低表达组后绘制生存曲线.分别检测临床标本结肠癌及癌旁组织中LBX2-AS1的表达并分析其与结肠癌临床病理特征的相关性.沉默SW480细胞株LBX2-AS1表达后,通过细胞增殖实验、细胞划痕实验、Transwell侵袭实验检测各组细胞的增殖、侵袭和转移能力.结果 通过GEPIA数据库检索发现LBX2-AS1与结肠癌患者的预后密切相关.UCSCxena数据库下载TCGA-COAD的生存信息分析提示,随着生存时间延长,高表达LBX2-AS1组存活例数明显少于低表达组;与癌旁组织比较,LBX2-AS1在结肠癌组织中明显高表达,且表达水平与患者年龄、性别临床参数无关,与结肠癌的病理分期及淋巴结转移呈正相关.沉默LBX2-AS1后结肠癌细胞SW480细胞增殖率明显降低,划痕距离明显增宽,侵袭细胞数明显减少,差异有统计学意义(P＜0.05).结论 基于生物信息学分析,结合临床数据及细胞实验验证,LncRNA LBX2-AS1在结肠癌中起促癌作用.
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分类号
R735.35（消化系肿瘤）
栏目名称
DOI
10.20116/j.issn2095-0616.2024.13.01
发布时间
2024-09-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
广西壮族自治区卫生健康委员会科研课题（Z-B20221564）
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