基于网络药理学、分子对接及分子动力学模拟探讨黄芪治疗颈椎病的作用机制
Exploring the mechanism of Astragalus membranaceus in treating cervical spondylosis based on network pharmacology,molecular docking,and molecular dynamics simulation
摘要目的 通过网络药理学、分子对接及分子动力学模拟研究黄芪治疗颈椎病的作用机制.方法 利用中药系统药理学数据库得到黄芪中的有效成分以及它们所对应的靶点基因信息,利用人类基因数据库、人类孟德尔遗传数据库查找颈椎病疾病靶点,并获取交集靶点,以黄芪活性成分-颈椎病疾病靶点建立蛋白相互作用图.通过Metascape平台开展基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并采用Autodock 1.5.7 版等软件进行分子对接及分子动力学模拟验证.结果 筛选出黄芪主要活性成分为槲皮素、芒柄花黄素、毛蕊异黄酮等,作用于 8 个颈椎病疾病靶点.黄芪治疗颈椎病的核心基因主要有IL-1β、IL-6、ESR1、MMP3 等.GO和KEGG富集分析结果黄芪治疗颈椎病主要涉及类风湿性关节炎、IL-17/Th17 细胞分化、炎症性肠病、TLR/TNF/HIF-1 通路等.分子对接验证MMP3-毛蕊异黄酮,MMP3-芒柄花黄素与MMP3-槲皮素之间具有关键的结合活性,能够稳定对接.分子动力学模拟结果表明MMP3-毛蕊异黄酮的蛋白质构象更趋于稳定.结论 黄芪治疗颈椎病具有多成分、多靶点和多通路的特点,而MMP3-毛蕊异黄酮的蛋白质构象稳定性突出,可能在治疗颈椎病中起到关键作用.
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