换一批
换一批Tn1548相关区域在不同种属临床分离菌中多态性及armA跨种属转移可能的机制
Polymorphism of Tn1548 associated regions in different species and possible mechanism of armA interspecies transfer
摘要目的 复合转座子Tn1548一直被认为介导了armA基因的转移,本研究通过分析armA基因在不同种属的基因环境,提出armA基因转移的可能机制.方法 以GenBank库不同种属细菌中已经发现的含有Tn1548及Tn1548-like转座子为研究对象,通过生物信息学技术比较分析armA基因环境的差异,结合armA基因环境中各种插入元件的工作机制,推测armA基因跨种属转移的可能机制.结果 一共有11条含有Tn1548或者Tn1548-like的全质粒序列纳入分析.这些质粒序列来自不同种属,包括鲍曼不动杆菌、肠杆菌科细菌、铜绿假单胞菌.除鲍曼不动杆菌和铜绿假单胞菌的质粒类型的不相容组别未知外,其他种属来源的质粒不相容组别涉及IncU、IncFII(Yp)、IncN、IncL/M、IncL/M、IncA/C2和IncR嵌合型,IncA/C、IncFIIK和IncT.上述结果强烈的提示armA基因的跨种属转移不是质粒的广泛播散而更可能是转座子或者更小的可移动元件参与其中的事件.进一步对Tn1548、Tn1548-like转座子及Tn1548相关区域的分析发现了armA基因在转移中侧翼的相对保守区是ISCR1-armA-IS26结构.结论 结合ISCR1和IS26元件的工作机制,推测ISCR1-armA-IS26结构极有可能介导了armA基因在不同种属的广泛播散.
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