小鼠脑微血管内皮细胞与新生隐球菌 GXM 作用后基因表达谱分析
Gene expression profiling analysis of mouse brain microvascular endothelial cells incubated with glycuro-noxylomannan of Cryptococcus neoformans
摘要目的:探索新生隐球菌 GXM 能否影响脑微血管内皮细胞基因的表达,为进一步研究隐球菌嗜中枢性的分子机制提供线索。方法使用 Roche NimbleGen 12×135K 小鼠基因表达谱芯片,筛选小鼠脑微血管内皮细胞系 bEnd.3与不同浓度新生隐球菌 GXM 作用后差异表达的基因;结合基因本体论(Gene Ontology),使用 topGO 进行差异基因 GO 分析,结合 GO语义挖掘与隐球菌侵袭中枢神经系统能力相关的差异表达基因的信息;采用荧光实时定量 PCR 对重要基因 PIK3C2G 和ADAMDEC1的表达水平变化加以验证。结果 bEnd.3细胞与新生隐球菌 GXM 作用前后基因表达对比发现,实验组 GXM (90μg/ m)组总共有402个基因表达上调,296个基因表达下调,GXM (180μg/ m)组总共有421个基因表达上调,564个基因表达下调,细胞膜、细胞骨架、磷酸肌醇?3?激酶活化、1?磷酸肌醇?3?激酶活化、细胞紧密连接等生物过程差异表达基因较为富集;对 PIK3C2G 基因和 ADAMDEC1基因表达水平变化进行荧光定量 PCR 验证,结果与芯片结果一致,基因表达水平不同程度上升,且与 GXM 浓度正相关。结论新生隐球菌 GXM 能够影响脑微血管内皮细胞基因表达,PIK3C2G 基因、ADAM?DEC1基因表达上调可能和隐球菌穿越血脑屏障有关。
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