基于生物信息学方法分析MFAP2基因在胃癌预后及免疫治疗中的意义

Bioinformatic screening reveals the significance of MFAP2 in the prognosis and immunotherapy of gastric cancer

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摘要目的:筛选影响胃癌患者预后及治疗的关键基因,分析关键基因微纤维相关蛋白2(MFAP2)在提示胃癌患者预后及免疫治疗敏感性中的价值.方法:从TCGA数据库下载胃癌患者的癌和癌旁组织的表达谱数据及临床资料.综合加权基因共表达网络分析(WGCNA)和单因素Cox回归分析筛选与胃癌预后显著相关的基因.使用多个患者队列评估关键基因MFAP2的预后价值,分析其效能和临床病理指标的相关性.使用多个在线数据库数据及算法分析MFAP2与肿瘤免疫微环境的关联,免疫表型评分(IPS)联合免疫治疗患者队列分析MFAP2在预测免疫治疗响应性中的价值.采用多数据集验证MFAP2在胃癌及癌旁组织中的表达差异.结果:蓝色模块与胃癌患者的生存结局相关性最高(R=0.17,P<0.001);进一步与预后相关基因取交集,共筛选到20个关键基因.关键基因MFAP2的高表达提示胃癌的不良预后和病理进展(HR>1,P<0.05).MFAP2与肿瘤相关成纤维细胞密切相关,高表达MFAP2的胃癌患者对免疫治疗更不敏感.多数据集验证结果显示,MFAP2 mRNA在胃癌组织中高表达(P<0.05或P<0.01).结论:MFAP2的高表达是胃癌预后不良和免疫治疗响应不佳的提示因子,有望作为胃癌的新型治疗靶点和预后标志物.