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基于WGCNA揭示贝沙罗汀通过调控c-Myc通路抑制双打击淋巴瘤的机制

Mechanism of bexarotene in suppressing double hit lymphoma via modulation of the c-Myc pathway:Insights from WGCNA

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摘要目的:基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)探讨贝沙罗汀治疗双打击淋巴瘤(DHL)的分子机制,为DHL治疗提供潜在靶点和实验依据.方法:从基因表达综合数据库(GEO)下载GSE44164和GSE43677表达谱数据集,筛选出差异表达基因(DEG).采用WGCNA识别与DHL相关的基因模块,构建蛋白质相互作用(PPI)网络以筛选关键基因.通过药物预测平台EpiMed进行关联分析以确定DHL的潜在靶向治疗药物.利用CCK-8法和WB法检测贝沙罗汀对DHL细胞增殖及关键蛋白表达的影响,通过流式细胞术评估贝沙罗汀诱导细胞凋亡的效果.结果:WGCNA识别出与DHL高度相关的碧绿色模块,在PPI网络中筛选出10个枢纽基因,包括COL1A2、COL3A1、MMP2、COL5A2、DCN、BGN、FN1、MMP9、FBN1和LUM.药物关联分析确定贝沙罗汀为潜在治疗药物.体外实验显示,贝沙罗汀显著抑制U2932细胞活力(P<0.05)、促进细胞凋亡(P<0.001)、下调细胞中c-Myc和COL1A2的表达(均P<0.05).结论:贝沙罗汀可能通过抑制c-Myc信号通路及调控细胞外基质相关基因发挥抗DHL作用,其体内疗效及联合治疗潜力需进一步验证.

作者何田田 ^[1] 李泓毅 ^[2] 耿杰 ^[3] 侯传东 ^[2] 张虹 ^[4] 张辉 ^[1] 赵鹏 ^[5] 卢学春 ^[6] 贺培风 ^[5] 学术成果认领

作者单位山西医科大学医学科学院,山西太原 030001 ^[1] 解放军医学院,北京 100853 ^[2] 山西医科大学基础医学院,山西太原 030001 ^[3] 解放军总医院第二医学中心呼吸与危重症医学科,北京 100853 ^[4] 山西医科大学管理学院,山西太原 030001 ^[5] 解放军总医院第二医学中心血液科,北京 100853 ^[6]

关键词双打击淋巴瘤贝沙罗汀基于加权基因共表达网络分析生物标志物分子机制 double hit lymphoma(DHL)bexarotene Weighted Gene Co-expression Network Analysis(WGCNA)biomarker molecular mechanism

分类号 R730.4（肿瘤学一般性问题）R730.5（肿瘤学一般性问题）

栏目名称

基础研究

DOI 10.3872/j.issn.1007-385x.2025.07.006

发布时间 2025-08-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

基金项目

国家老年疾病临床医学研究中心多中心RCT临床研究项目（No.NCRCG-PLAGH-20230010）军队后勤保健课题（No.23BJZ25）国家自然科学基金（No.72474125）