单细胞测序技术揭示糖尿病肾脏疾病中足细胞与壁层上皮细胞间细胞通讯模式
Single-cell Sequencing Technology Reveals the Cell-to-cell Communication Pattern Between Podocyte and Parietal Epithelial Cells in Diabetic Kidney Disease
摘要目的:利用单细胞测序技术分析糖尿病肾脏疾病中肾小球壁层上皮细胞与足细胞的差异表达基因及两者的细胞通讯模式.方法:C57BL/6J小鼠随机分为对照组(n=2)和糖尿病肾病组(n=3).糖尿病肾病组腹腔注射链脲佐菌素建立糖尿病肾脏疾病模型.将肾脏制成单细胞悬液后进行单细胞RNA测序分析.首先对测序数据进行质控、降维聚类,根据标记基因进行注释;利用Monole2 进行细胞拟时间分析;利用CellChat分析细胞互作关系.结果:共获取 38 655 个细胞纳入下游分析,鉴定出13 个细胞簇.在足细胞中共鉴定出 25 个差异基因,包括多个铁死亡相关基因(Nupr1、Ftl1 和Gpx4).KEGG分析显示壁层上皮细胞的差异基因富集在铁死亡信号通路中.壁层上皮细胞与足细胞之间存在显著的互作关系.壁层上皮细胞以旁分泌和自分泌的方式驱动 AGRN、GAS、HH、IGF等多种信号作用于足细胞,是壁层上皮细胞和足细胞之间串扰的主要信号.结论:铁死亡在糖尿病肾脏疾病中的足细胞和壁层上皮细胞中起重要作用,肾小球足细胞和壁层上皮细胞中存在复杂的细胞传导信号.
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