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工业循环冷却水来源的嗜肺军团菌基因组学特征分析

Genomic characterization of Legionella pneumophila isolated from industrial circulating cooling water

摘要目的 分析工作场所工业循环冷却水来源的嗜肺军团菌的基因组学特征.方法 选择在8家化工企业采集的工业循环冷却水来源的20株嗜肺军团菌为研究对象.对菌株进行全基因组测序,并进行多位点序列分型(MLST)、全基因组单核苷酸多态性分析、致病菌毒力基因和抗生素抗性基因检测分析.结果 20株嗜肺军团菌的优势MLST型别为ST2型,Lp1型嗜肺军团菌具有较高的遗传多样性.不同企业来源的菌株具有较高的基因组多样性,可能存在企业间播散的趋势.每个嗜肺军团菌分离株检测到175~295种毒力基因;其中,139种毒力基因在20株嗜肺军团菌中均被检测到,主要包括Dot/Icm Ⅳ型细菌分泌系统相关基因、鞭毛合成、运动相关基因和Ⅳ型菌毛相关基因等.不同ST分型的嗜肺军团菌携带的毒力基因数目比较,差异有统计学意义(P<0.01);其中,未知型的毒力基因数目高于其他ST型(P<0.01).共预测到氨基糖苷磷酸转移酶编码基因APH(9)-Ia、碳青霉烯酶编码基因OXA-29和外排泵编码基因LpeA、LpeB共4个抗性基因,检出率分别为100.00%、100.00%、10.00%和10.00%,可能对头孢菌素类、青霉素类和氨基糖苷产生耐药性,且均为多重耐药.结论 工业循环冷却水来源的嗜肺军团菌污染具有较高的遗传多样性、致病性和多重耐药潜力.

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