换一批基于网络药理学、分子动力学模拟和体外实验验证探讨骨方颗粒治疗骨质疏松症作用机制
Exploration on the Mechanism of Gufang Granules for the Treatment of Osteoporosis Based on Network Pharmacology,Molecular Dynamics Simulations and in Vitro Experimental Validation
摘要目的 通过网络药理学、分子动力学模拟和体外实验验证,探讨骨方颗粒治疗骨质疏松症的潜在靶点和作用机制.方法 通过TCMSP数据库和文献获取骨方颗粒的有效成分,利用SwissTargetPrediction数据库预测相关靶点.通过蛋白相互作用网络分析和机器学习模型筛选药物核心靶点,绘制独立验证数据集的受试者工作特征曲线以评估模型的预测性能.使用基因集富集分析核心靶点的表达和通路.应用分子动力学模拟分析化合物-靶点复合物的结构稳定性和相互作用.采用CCK-8法筛选药物的非细胞毒性浓度,以低、中、高浓度含药血清分别处理RAW264.7细胞,通过TRAP染色法计数破骨细胞,qRT-PCR和Western blot检测相关基因和蛋白表达.结果 通过网络药理学分析获得骨方颗粒潜在有效成分251个、相关靶点1 078个,其中核心靶点SRC和TNF的高表达主要与破骨细胞分化、MAPK信号通路和PI3K/Akt信号通路相关.分子动力学模拟显示,核心活性成分Glabridin与SRC、TNF靶蛋白具有较强的稳定性及相互作用.骨方颗粒各浓度组TRAP染色阳性细胞数量较RANKL组明显减少(P<0.01,P<0.001);骨方颗粒含药血清可显著降低NFATc1、CTSK、SRC、TNF-α mRNA表达,并显著下调NFATc1、CTSK、p-SRC、TNF-α蛋白表达(P<0.05,P<0.01,P<0.001).结论 骨方颗粒可能通过下调NFATc1、CTSK、p-SRC、TNF-α表达抑制破骨细胞分化,从而减缓骨质疏松症的病理进程.
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关键词
骨质疏松症骨方颗粒网络药理学分子动力学模拟破骨细胞osteoporosisGufang Granulesnetwork pharmacologymolecular dynamics simulationsosteoclast
分类号
R285（中药学）
栏目名称
DOI
10.19879/j.cnki.1005-5304.202408448
发布时间
2025-03-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
辽宁省教育厅高等学校基本科研项目（LJKMZ20221327）
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