换一批
换一批铁皮石斛Ty1-copia类反转录转座子反转录酶(RT)序列的克隆与分析
Cloning and analysis of reverse transcriptase(RT) of Ty1-copia retrotransposons in Dendrobium officinale
摘要该研究根据Ty1-copia类反转录转座子RT的通用引物,从铁皮石斛浙江临安(C15)和云南广南(A39)种质中扩增得到43条Ty1-copia类反转录转座子RT序列,这些核苷酸序列具有较高的异质性,主要表现为,序列长度变化范围260～266 bp,终止密码子和移码突变,所有序列均富含碱基AT,一致性为47.1％ ～97.7％.经plantCARE软件分析发现受低温、热、光、各种植物生长调节物质等不同胁迫条件作用的调控元件、多个启动子的特征结构TATA box和CAAT box的保守序列及其他一些调控元件.翻译成氨基酸后,有10条序列出现1～4个不同程度的终止密码子突变,5条序列出现移码突变,保守序列“SLYGKQ”发生变异的有39条序列.其氨基酸序列经过系统聚类后可分为6类;且与其他植物(尤其是单子叶植物的小麦、荸荠)具有较高的同源性,表明它们间可能存在着Ty1-copia反转录转座子的横向传递.
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关键词
铁皮石斛Ty1-copia类反转录转座子反转录酶(RT)异质性Dendrobium officinale Ty1-copia-like retrotransposon reverse transcriptase(RT) heterogeneity
栏目名称
资源与鉴定
DOI
10.4268/cjcmm20140210
发布时间
2014-08-15
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