基于网络药理学的紫斑牡丹花、叶抗菌活性和作用机制研究
Exploration on antibacterial activity and mechanism of flowers and leaves from Paeonia rockii based on network pharmacology
摘要该研究考察紫斑牡丹花、叶的抗菌活性,筛选其抗菌主要活性成分,预测抗菌靶点,探讨其多成分、多靶点抗菌作用机制.首先,采用微量稀释法测定甲醇、乙酸乙酯提取紫斑牡丹花、叶对金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、枯草芽孢杆菌、蜡样芽胞杆菌、大肠杆菌、肺炎克雷伯氏菌、铜绿假单胞菌的最小抑菌浓度(MIC).其次,利用Uniprot数据库找到相对应的基因靶点,并通过RCSB网站寻找相对应的蛋白亚型的PDB ID以及小分子结构为受体,前期已鉴定的紫斑牡丹花、叶化学成分以PubChem等数据库进行结构确认,通过ChemDraw,Avogadro和Discovery Studio Visualizer软件进行配体的构建,采用QuickVina 2.0软件进行分子对接.最后,借助Cytoscape 3.5.1软件绘制活性成分与抗菌靶点网络图,使用Uniprot在线数据库进行靶点基因功能及代谢通路进行分析.实验结果表明紫斑牡丹花、叶提取物具有抗菌活性,紫斑牡丹花甲醇提取物具有最强的抗菌作用.网络分析表明紫斑牡丹花、叶中筛选得到活性成分29个,抗菌靶点18个.通过紫斑牡丹花、叶活性成分与抗菌靶点网络数的比较,预测其抗菌成分主要是黄酮和酚酸,抗菌机制主要是抑制细菌蛋白的合成.该研究通过体外抗菌实验和网络药理学的筛选,发现紫斑牡丹花、叶提取物具有抗菌活性,为紫斑牡丹花、叶抗菌机制研究提供新的思路和线索.
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