换一批
换一批基于转录组测序挖掘国槐花蕾黄酮类物质生物合成相关基因
Transcriptome analysis reveals candidate genes involved in flavonols biosyhthesis in Sophora japonica
摘要为研究国槐黄酮类物质的生物合成途径,利用高通量测序技术对国槐花蕾进行转录组测序,经Trinity软件组装获得113 907条unigenes,平均长度803 bp,其中72 752条unigenes在数据库获得注释信息,共搜索到38 891个SSR位点.通过代谢通路分析,发现国槐转录组中有135个unigenes参与黄酮类生物合成,有959条unigene参与其他次生代谢途径.进一步分析参与国槐芦丁生物合成相关基因,发现有24个与CHS相关,有52个与FLS相关,有11个与UFGT相关.国槐转录组数据的获得为研究国槐黄酮类物质生物合成途径奠定了基础,也为槐米药材品质的形成提供理论依据.
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发布时间
2018-12-10
基金项目
重庆市基本科研业务费项目（cstc2017jxjl-jbky0020）；
重庆市林业重点科技攻关项目（2016-14）；
国家中药材产业技术体系（CARS-21）；
重庆市“科技平台与基地建设”项目（cstc2014ptyjd10001）；
重庆市中药材产业技术体系建设项目（2017[5]号）
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