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褪色HE染色切片ALK基因融合检测可行性探索

Feasibility exploration of ALK gene fusion detection in faded HE-stained sections

摘要目的 探索利用HE染色切片褪色样本进行ALK基因融合检测的可行性.方法 选取3例ALK基因融合阳性的福尔马林固定石蜡包埋(formalin fixed and paraffin embedded,FFPE)组织样本的HE染色切片,分别经盐酸乙醇褪色法和高锰酸钾草酸氧化漂白法褪色后,提取RNA,采用荧光定量RT-PCR(qRT-PCR)技术,检测ALK基因融合.结果 从经盐酸乙醇褪色法或高锰酸钾草酸氧化漂白法褪色的HE染色切片中提取的RNA的纯度与从对照切片中提取者无显著差异,但其浓度较从对照切片中提取者显著降低.在模板量相同的条件下,经盐酸乙醇褪色的HE染色切片与对照组切片均检测到明确的ALK基因融合阳性,而经高锰酸钾草酸褪色的HE染色切片无任何曲线升起.从经盐酸乙醇褪色的HE染色切片中提取的RNA的完整性与从对照切片中提取的RNA的完整性无差异,但显著高于从经高锰酸钾草酸褪色的HE染色切片中提取者.为保证研究的准确性,本研究采用免疫组织化学与荧光原位杂交法对选取的ALK基因融合阳性样本进行验证,结果发现所选样本均为明确阳性.结论 HE染色切片经盐酸乙醇褪色后提取的RNA可以用于ALK基因融合检测.

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中国组织化学与细胞化学杂志

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