小反刍兽疫病毒液滴式数字PCR检测方法的建立及应用
Establishment and Application of a Droplet Digital PCR Assay for Detection of Peste des Petits Ruminants Virus
摘要为实现小反刍兽疫病毒(Peste des petits ruminants virus,PPRV)的快速、准确、定量检测,以国内PPRV Clone 9 疫苗株 N 基因为靶位点设计特异性引物及探针,建立了液滴式数字 PCR(Droplet digital PCR,ddPCR)方法,并对其特异性、敏感性及重复性进行评价.将所建立的ddPCR方法与实时荧光定量PCR(Fluorescence quantitative PCR,qPCR)方法的灵敏度进行比较分析并应用于PPRV(Clone 9 株)核糖核酸标准物质的定量.结果显示,所建立的 ddPCR 方法特异性好,仅PPRV检测结果为阳性,其他羊源病毒类生物制品及毒种检测结果均为阴性;敏感性高,基因拷贝数检出限度为4.33 拷贝/μL,比qPCR方法的灵敏度(57.3 拷贝/μL)高10 倍;重复性好,重复性试验的变异系数为1.8%;定量准确,具有一定资质的9 家单位各组测量数据组间变异系数小于5%.试验建立的ddPCR方法能够有效地对PPRV核酸进行快速检测,为PPRV的诊断及绝对定量提供了有效方法.
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