低误差第二代测序技术应用于肿瘤研究和药物致突变性风险评价的进展
Advances of the Low-Error Next-Generation Sequencing Technology Applied in Cancer Research and Drug Mutagenic Risk Evaluation
摘要目的:探讨低误差第二代测序(next-generation sequencing,NGS)技术在肿瘤研究和药物致突变性评价领域的进展.方法:通过查阅文献、收集资料等方法,汇总近年来低误差NGS技术进展、优缺点以及在肿瘤研究和药物致突变性/致癌性评价的应用.结果:传统的NGS技术的背景误差率较高,限制其在低频率突变检测方面的应用.近年开发的多种低误差NGS技术(即校正测序错误的NGS,error-corrected next-generation sequencing,ecNGS)可将NGS的检测误差率降低至10-7~10-4或甚至更低,满足肿瘤临床监测和指导用药的需求.此外,HiFi-Seq和PECC-Seq等技术的最低误差率可降低至10-8,可检出药物短期暴露导致的细胞/组织的超低频突变,有助于在药物研发早期评估其致癌性风险.结论:ecNGS技术目前处于开发阶段,尚未标准化,且未在临床、毒理学、风险评估领域推广应用.然而,该方法可直接检出肿瘤早期病变组织中的突变和药物诱导的组织/细胞突变,有望取代或补充现有的致突变性试验方法,纳入相关指导原则,成为药物早期遗传毒性、致癌性筛查的金标准.
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