小篷竹叶绿体基因组特征及比较分析
Chloroplast Genome Characteristics of Ampelocalamus luodianensis and Comparative Analysis
摘要利用高通量测序技术对小篷竹进行测序,并对其叶绿体全基因组序列的结构特征进行分析.小篷竹叶绿体基因组结构与大多数被子植物一样,为典型的四分体结构,序列全长 139547 bp;共注释 129 个基因,包含 83 个编码基因、8 个 rRNA基因,38 个 tRNA基因;识别到 31 种密码子具有明显的偏向性,其RSCU值超过 1.0;检测到 84 个 SSR位点和 65 个重复序列.系统发育分析表明,小篷竹与钓竹和南川竹的亲缘关系最近,互为姐妹类群.
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