利用CRISPR/Cas9基因编辑技术构建敲除4EBP1基因的乳腺癌细胞系
Construction of 4EBP1 knockout breast cancer cell lines using CRISPR/Cas9 gene editing technology
摘要目的:利用规律性重复短回文序列簇/相关基因9(CRISPR/Cas9)编辑技术构建真核翻译起始因子4E结合蛋白1(4EBP1)基因敲除的人乳腺癌MCF-7、ZR-75-1细胞系。方法:设计能特异性针对4EBP1基因的特异性向导RNA(sgRNA),以lentiCRISPR v2质粒为骨架构建能表达sgRNA和Cas9蛋白的重组质粒。测序鉴定后将重组质粒与逆转录病毒包装质粒pMD2.G、psPAX2共同转入HEK 293T细胞进行慢病毒包装,收集病毒上清感染人乳腺癌MCF-7、ZR-75-1细胞。利用嘌呤霉素筛选4EBP1表达缺失的MCF-7、ZR-75-1细胞,DNA测序和Western blot验证。在MCF-7、ZR-75-1野生型与4EBP1基因敲除的细胞中转入pcDNA3-rluc-poli-IRESfluc质粒,并用双荧光素酶报告基因实验检测4EBP1、4EBP1不同突变体对帽子依赖翻译的影响,以海肾荧光素酶与萤火虫荧光素酶比值(R/F比值)来表示帽子依赖的翻译水平。R/F比值的组间比较采用t检验,两两比较采用LSD法。结果:Western blot结果显示构建的3种lentiCRISPR v2-4EBP1-KO重组质粒转染MCF-7、ZR-75-1细胞后,4EBP1蛋白的表达水平均明显降低,说明4EBP1基因敲除成功。DNA测序发现MCF-7细胞的DNA序列中sgRNA出现了T碱基的插入突变,在ZR-75-1细胞DNA序列中sgRNA出现了GC碱基的缺失突变,证明细胞基因组DNA中的基因编辑成功。野生型和4EBP1基因敲除的ZR-75-1细胞中测得的R/F比值分别为1.83±0.10和5.48±0.33,组间比较差异有统计学意义(t=-18.338,P<0.001)。野生型和4EBP1基因敲除的MCF-7细胞中测得的R/F比值分别为1.17±0.06和2.03±0.20,组间比较差异有统计学意义(t=-7.167,P<0.001)。4EBP1基因敲除、敲除后分别转染4EBP1、plv-neo-4EBP1-37/46和plv-neo-4EBP1-4A的4种ZR-75-1细胞中测得的R/F比值分别为5.48±0.33、3.83±0.10、3.53±0.23和1.87±0.05,组间比较差异有统计学意义(F=151.995,P<0.001);4种MCF-7细胞中测得的R/F比值分别为2.03±0.200、1.37±0.14、1.90±0.19和1.20±0.17,组间比较差异有统计学意义(F=5.744,P=0.001)。结论:4EBP1基因敲除乳腺癌细胞系可用于后续不同4EBP1磷酸化突变体对翻译起始作用的进一步研究。
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