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FAM91A1 可能是乳腺癌患者的独立预后因子

FAM91A1 is a potential prognostic factor in breast cancer

摘要目的研究FAM91A1 表达是否能作为乳腺癌独立预后因子,并探讨其可能的影响机制。方法利用UALCAN 数据库中的“TCGA”模块获得FAM91A1 在乳腺癌各个分型中的mRNA 表达,同时从TCGA 数据库获得1101 例乳腺癌患者表达谱及临床数据,将患者按FAM91A1 表达量中位值(37.653)分成低表达组(n =550)和高表达组(n =551)。 使用R 4.4.1 软件包进行生存分析,比较FAM91A1 高、低表达的乳腺癌患者的OS 差异。 采用Cox 回归分析寻找乳腺癌患者OS 的影响因素。 分析FAM91A1 与免疫检查点的相关性,同时使用Spearman 相关性分析描述FAM91A1 与肿瘤突变负荷的相关性。 利用STRING 网站及GEPIA2 数据库构建FAM91A1 相关基因数据集,采用GO 及KEGG 富集分析研究FAM91A1 功能及相关通路,利用MiRTarbase 数据库构建FAM91A1 相关ceRNA 网络并用StarBase 数据库进行验证。结果TCGA 数据库中FAM91A1 mRNA 在正常人群、Luminal 型、HER-2 阳性型及三阴型乳腺癌患者中的表达差异有统计学意义(P<0.001)。 生存分析显示, FAM91A1 基因高表达组患者与低表达组患者的OS 比较差异没有统计学意义(HR =1.36,95%CI:0.91 ~2.05,P =0.133)。Cox 回归分析显示年龄(HR=1.453,95%CI:1.128~1.875,P =0.004)、临床分级(HR =1.773,95%CI:1.125~2.794,P=0.014)、M 分期(HR =2.155,95%CI: 1.365 ~3.403,P<0.001)和FAM91A1 表达(HR =1.297,95%CI:1.031~1.631,P =0.026)是1101 例乳腺癌患者OS 的影响因素。 免疫检查点LGLEC15、LAG3、PDCD1、HAVCR2、CD274、PDCD1LG2 表达在FAM91A1 高、低表达组间具有明显差异(P 均<0.001),FAM91A1 表达与肿瘤突变负荷呈正相关(P <0.001)。 GO 功能富集分析发现FAM91A1 相关基因数据集多富集在小分子与脂质等代谢生物过程,在外部封装结构、细胞单元格边沿等细胞成分中,以及酶激活剂活性、GTP 酶激活剂活性、金属肽酶活性等分子功能中。 在KEGG 通路富集分析中,FAM91A1 相关基因多富集在ABC 转运蛋白通路、脂肪酸代谢通路等。 利用在线数据库,共得到1 个miRNA(hsa-mir-15a-5p)和7 个lncRNA(LINC01128、ERI3-IT1、FGD5-AS1、LINC02035、TUG1、XIST、ARMCX5-GPRASP2)组成的FAM91A1 相关ceRNA 网络。结论FAM91A1 可能是乳腺癌的独立预后因子,且与免疫浸润、ABC 转运蛋白通路及脂肪酸代谢密切相关。

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