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胶质母细胞瘤缺氧与细菌生物被膜分子网络的拓扑共性分析

Topological commonality of glioblastoma hypoxia and bacterial biofilm networks

摘要目的 本研究旨在超越表型类比,探究胶质母细胞瘤(glioblastoma,GBM)缺氧与细菌生物被膜(bacterial biofilm)的分子互作网络(molecular interaction networks,MINWs)在结构上是否存在共性.方法 采用代数拓扑方法,分别分析胶质母细胞瘤缺氧调控网络(GBM-MINW)和细菌生物被膜网络(Biofilm-MINW)的拓扑不变量,并与随机网络进行对比.结果 两者均展现出复杂且稳定的非随机拓扑特征:网络中存在大量远超随机网络的高维单形与极大单形;持续同调分析进一步揭示,二者均具有高度稳定的拓扑特征,包括长生命周期的环形和空腔结构.结论 GBM-MINW与Biofilm-MINW具有相似的拓扑结构,均形成了高度互联且稳定的高维架构,此发现为理解生命系统复杂性的普遍规律提供了一个跨界案例.

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