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新型低密度cDNA Macroarray的建立及其应用于干扰素抗HBV的研究

Establishment of a new low-density cDNA Macroarray and the application in the activity of IFN against HBV

摘要目的了解人肝胚瘤细胞株Hep G2和稳定转染HBV全基因组细胞株HepG2.2.15的干扰素(IFN)抗病毒基因表达谱.方法选择与IFN抗病毒及其信号转导途径相关的288个IMAGE克隆,经聚合酶链反应(PCR)扩增相应的基因片段,将扩增的DNA片段纯化后点样于阳离子尼龙膜上以制备成人工芯片.Hep G2和HepG2.2.15细胞经IFN处理后,分离细胞总RNA,进行逆转录并且同时以32P标记;将标记的cDNA靶基因与尼龙膜上的探针进行分子杂交.经Cyclone扫描系统和OptiQuantTM软件处理,将图像信号转换成数据信息;再经Excel软件分析、处理形成Macroarray数据值.结果Macroarray分析提示,在Hep G2和HepG2.2.15细胞仅有部分IFN诱导基因表达,多数IFN诱导基因呈低表达或不表达.通过比较Hep G2和HepG2.2.15细胞,发现两者表达IFN诱导基因有差异,即对IFN应答有差异.进一步分析还发现,尽管与Hep G2细胞存在差异的IFN应答,HepG2.2.15细胞的IFN信号转导途径(Jak-STAT途径)却是开放的、未受损伤的.结论Hep G2和HepG2.2.15细胞具有差异的IFN抗病毒基因表达谱.

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