基于多色流式降维聚类方法的自发性细菌性腹膜炎患者T淋巴细胞亚群分析
Dimensionality reduction and clustering method of flow cytometric data for measuring T cell subpopulations in patients with spontaneous bacterial peritonitis
摘要目的:建立多色流式降维聚类分析方法,检测自发性细菌性腹膜炎(SBP)患者外周血和腹水中T细胞亚群,探讨SBP患者外周以及腹腔局部T淋巴细胞的表面标志物表达差异。方法:选取2021年12月至2022年1月就诊于首都医科大学附属北京地坛医院的4例SBP患者为研究对象。根据多色流式荧光搭配原则,初步确立检测外周血及腹水T淋巴细胞亚群比例的多色流式配色方案。利用健康对照者外周血单个核细胞(PBMCs)调节最适检测电压及荧光补偿;设定条件后,检测4例SBP患者的外周血及腹水样本。建立多色流式降维聚类分析方案以检测SBP患者外周血和腹水中T淋巴细胞的差异。结果:采用统一流形逼近和投影(UMAP)结合FlowSOM插件的多色流式降维分析法将CD4+ T细胞和CD8+ T细胞均分为12个细胞群。该降维聚类方法通过可视化UMAP图定位,并结合统计学分析初步发现,与外周血相比,SBP患者腹水中CD69+PD-1+ CD4+ TEM(t = 3.427、P = 0.0416)以及CD25-TIGIT-CD4+ TEM(t = 3.203、P = 0.0492)比例较高,差异有统计学意义。结论:多色流式降维聚类分析法用于检测SBP患者外周血及腹水样本中T淋巴细胞分群及功能,具有快速、准确、多维度并且可视化强的优点。
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