基于16s rRNA测序分析心理应激小鼠肠道菌群结构特征
The study on structural characteristics of intestinal flora of mice with chronic stress based on 16s rRNA sequencing
摘要目的:探讨心理应激(慢性束缚应激)对小鼠肠道菌群分步分类及其结构特征的影响。方法:将8周龄,SPF级雄性昆明小鼠随机分为2组,即正常组(C,n=8)和慢性束缚应激组(ST,n=8);ST组小鼠每天在自制式束缚器中限制活动2 h,其余时间2组小鼠在相同环境中自由饮水摄食,束缚实验持续14 d,利用16s rRNA高通量测序技术,检测2组小鼠肠道菌群丰度并对比分析ST组小鼠与C组小鼠的菌群组成差异。结果:ST组小鼠粪便菌群的有效序列得到282.00±36.69个操作单元(OTUs)聚类,其明显低于C组(353.00±26.67个OTUs,t=3.468,P=0.010);ST组的Chaol指数明显低于C组(357.93±45.89 vs 415.45±28.88,t=3.409,P=0.011);ST组的Simpson指数明显高于C组(0.19±0.08 vs 0.06±0.01,t=-4.325,P=0.003),提示ST组菌落丰富性及多样性低于C组。ST组的菌属中的Helicoba cteraceae(螺杆菌科)、Lactobacillaceae(乳杆菌科)、Muribaculaceae以及Moraxellaceae(莫拉菌科)的含量,与C相比明显的上升(P<0.05);同时,ST组小鼠肠道粪便菌群中的Lachnospiraceae(毛螺菌属)、Prevotellaceae(普雷沃氏菌)、Ruminococcaceae(瘤胃球菌科)、Firmicutes(厚壁菌)、Bacteroidetes(拟杆菌)以及Antinobacteria(抗细菌)的含量,与C相比明显的下降(P<0.05)。结论:心理应激诱导小鼠肠道菌群的多样性显著降低,菌群分布均发生显著变化。
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