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基于COI基因的赣北地区小泡巨鼠的鉴定

Identification of Leopoldamys edwardsi in Northern Jiangxi based on COI gene

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摘要目的以线粒体细胞色素C氧化酶亚基(COI)基因为目的基因,利用DNA条形码技术对未知鼠样本进行鉴定.方法采用夹夜法对九江市武宁县宋溪镇某村的鼠密度进行调查,经形态学初步鉴定后,以捕获的 1 只无法明确鉴定的大型鼠样本为对象,提取基因组DNA并采用COI基因通用引物BatL5310 和R6036R进行PCR扩增及测序,将测序结果在NCBI网站进行BLAST比对,采用MEGA7 软件选择最大似然法构建系统发育树.结果共捕获小型兽类7 只,密度为3.38%,经形态学鉴定有褐家鼠2 只,黑线姬鼠2 只,臭鼩鼱2只,形态学初步鉴定为青毛巨鼠或小泡巨鼠的未知鼠1 只,提取的未知鼠样本DNA通过PCR成功扩增出COI基因目的条带,与NCBI基因库中小泡巨鼠(KP995219)序列同源性高达 100%,系统发育树显示该鼠样本与小泡巨鼠(KP995219、KP995203)处于同一分支,遗传距离分别为 0、0.0016,而青毛巨鼠(NC_036730)单独处于另一分支,遗传距离较远.结论赣北地区首次报道小泡巨鼠,采用COI基因的DNA条形码技术可快速、准确的进行鼠种鉴定,有助于弥补非常见鼠形态学鉴定困难的不足.

作者陈飞 ^[1] 胡海军 ^[1] 刘占斌 ^[2] 陶卉英 ^[1] 钱科 ^[1] 郑卫青 ^[3] 学术成果认领

作者单位传染病预防控制国家重点实验室研究基地,江西省动物源与媒介生物性传染病重点实验室,南昌市疾病预防控制中心消毒与病媒生物防制科,江西南昌 330038 ^[1] 公安部南昌警犬基地,江西南昌 330100 ^[2] 传染病预防控制国家重点实验室研究基地,江西省动物源与媒介生物性传染病重点实验室,南昌市疾病预防控制中心消毒与病媒生物防制科,江西南昌 330038;海南医学院,热带医学院,海南海口 571199 ^[3]

关键词小泡巨鼠 DNA条形码细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因系统发育 Leopoldamys edwardsi DNA barcoding mitochondrial cytochrome C oxidase subunit I(CO I)phylogeney

分类号 R184.3（流行病学与防疫）

栏目名称

媒介监测

DOI 10.19821/j.1671-2781.2023.06.004

发布时间 2024-04-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

基金项目

南昌市医疗技术支撑计划重点项目（2022-KJZC-024）南昌市医疗技术支撑计划一般项目（2022-KJZC-018）