换一批三江源地区鼠疫耶尔森菌CRISPR基因分型及流行特征研究
Research on the CRISPR genotyping and epidemic characteristics of Yersinia pestis in the Sanjiangyuan region
摘要目的 了解三江源地区鼠疫菌株分布情况,进行规律间隔成簇短回文重复序列(Clustered regularly in-terspaced short palindromic repeats)基因分型研究,为该地区鼠疫疫源地菌株鉴定溯源、科学防控提供理论依据.方法 选取三江源地区 310 株鼠疫菌提取DNA,分别PCR扩增、测序 3 个CRISPR的位点YPa、YPb和YPc,所测得CRISPR序列与CRISPR Dictionary数据库最新数据进行比对,鉴定CRISPR spacer阵列并对三江源地区鼠疫菌进行基因分型.对 310 株鼠疫菌结合CRISPR基因型和分离宿主信息进行统计分析.结果 310 株鼠疫菌共发现26 种spacer,分别为YPa15 种、YPb8 种、YPc3 种;310 株鼠疫菌被分成16 个不同CRISPR基因型,G22 型和G22-a1′型分布于整个三江源地区包括称多县、治多县、玉树市、曲麻莱县、囊谦县、杂多县、玛多县、玛沁县、同仁县、泽库县、共和县、同德县、贵德县;G24 型分布于泽库县、玛多县、囊谦县、称多县;G26-a1′型主要分布于共和县、兴海县、贵德县、玛多县、称多县、杂多县,16 个基因型归类为 7 个CRISPR类群:Cb4、Cb4′、Ca7、Ca7′、Ca8、Ca35′、Cc3′.结论 三江源地区鼠疫菌CRISPR基因型具有多样性,不同疫源地基因型分布特征显著,且不同菌株基因型存在差异.
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分类号
R184.3（流行病学与防疫）
栏目名称
DOI
10.19821/j.1671-2781.2024.02.015
发布时间
2024-06-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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