台湾乳白蚁工蚁和兵蚁的转录组测序比较及表达分析
Comparative transcriptome sequencing and expression analysis of workers and soldiers of Coptotermes formosanus
摘要目的 了解台湾乳白蚁Coptotermes formosanus Shiraki工蚁和兵蚁的转录组特征,为阐明工蚁和兵蚁品级分化的分子机制提供理论依据.方法 对工蚁和兵蚁的头部组织进行转录组测序,对比两者之间的差异表达基因(DEGs),并进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库信号通路和基因本体(GO)数据库功能富集分析.结果 台湾乳白蚁转录组测序数据为 39.13 Gb,经质控过滤后得到262 172 274 条clean reads,GC含量为 38.69%~41.27%.工蚁和兵蚁有 996 个DEGs.GO功能注释结果显示,涉及生物过程的DEGs最多;KEGG信号通路富集结果显示,工蚁和兵蚁的DEGs显著(Padjust<0.05)富集在单磷酸腺苷激活的蛋白激酶(AMPK)信号通路.结论 工蚁和兵蚁在基因上的差异对应了它们各自的社会分工,差异基因的上调基因与免疫防御有关,下调基因与能量代谢和蛋白合成相关.
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