基于链置换分子探针的miRNA高特异性检测研究

Strand displacement-based molecular probe for high-specificity detection of microRNA

二维码有效期 120s

摘要目的建立一种新型分子探针设计方法,用于提高microRNA检测灵敏度和特异性.方法实验研究.利用链置换原理将靶标杂交序列部分设计在分子信标茎端,在此基础上再利用核酸结构分析软件DNAman优化分子探针的二级结构设计出新的探针,分别称为链置换优化探针(MB-D)和链置换二级结构优化探针(MB-D plus),将MB-D和MB-D plus与传统分子信标(MB-C)对比检测microRNA-21及其单碱基突变体,分析不同探针对于microRNA检测的最低检出限、重复性和特异性等.结果 MB-C对microRNA-21的最低检出限为1 nmol/L,MB-D和MB-D plus的最低检出限分别为0.1 nmol/L和0.01 nmol/L;所建立的MB-D plus探针可以显著区分miR-21与单核苷酸突变靶标.结论基于链置换原理并通过二级结构优化的分子探针可显著提高探针对于microRNA检测的灵敏度和特异性.

作者刘炼华 ^[1] 陈晓辉 ^[2] 周旋 ^[3] 陈菲 ^[4] 戴玲 ^[5] 张洪 ^[2] 罗阳 ^[6] 贾玫 ^[1] 学术成果认领

作者单位 100044,北京大学人民医院检验科 ^[1] 陆军军医大学(第三军医大学)第一附属医院检验科 ^[2] 石河子大学医学院 ^[3] 重庆医科大学 ^[4] 陆军军医大学(第三军医大学)第一附属医院临床基础检验与军事检验医学教研室 ^[5] 重庆大学生物工程学院;陆军军医大学(第三军医大学)第一附属医院检验科 ^[6]

关键词微RNAs 分子探针敏感性与特异性

主题词分子探针(Molecular Probes)敏感性与特异性(Sensitivity and Specificity)研究(Research)方法(Methods)突变(Mutation)

栏目名称论著

DOI 10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2018.07.012

发布时间 2018-08-23

基金项目

国家自然科学基金 重庆市杰出青年基金