换一批应用复合诱导突变分离PCR法检测mtDNA的单核苷酸多态性
Multiplexed mutagenicaliy separated PCR assay for rapid detection of SNP loci in mitochondrial DNA coding region
摘要目的 应用复合诱导突变分离PCR(multiplexed mutagenically separated PCR,MS-PCR)技术、银染分型,建立线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)编码区单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism,SNP)分型系统,探讨其应用价值.并调查了成都汉族群体mtDNA编码区4个SNP基因座等位基因频率和单倍型分布情况.方法 根据SNP基因座(C12705T、A8701G、G8584A、C10400T)设计两条片段相差4个碱基的等位基因特异性引物和一条公共引物,4个SNP基因座复合扩增,PCR产物经聚丙烯酰胺凝胶电泳、银染显带后确定样本的基因型.结果 不同SNP基因座为长度不同的单一谱带,其分型结果与直接测序一致.在成都汉族160名无关个体中,4个SNP基因座C12705T、A8701G、G8584A、C10400T等位基因频率分别为0.3813/0.6187、0.4813/0.5187、0.8250/0.1750、0.4938/0.5062;共检出6种单倍型,单倍型的基因多样性为0.7137.结论 建立的MMS-PCR银染分型系统是一种简单、快速、准确、有效的SNP分型方法,对建立mtDNA编码区SNP数据库,研究群体遗传学、进化学和进行法医学个人识别和亲子鉴定有重要意义.
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医学主题词
突变(Mutation)线粒体(Mitochondria)多态性, 单核苷酸(Polymorphism, Single Nucleotide)基因座(Genetic Loci)聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction)
分类号
R4（临床医学）
栏目名称
DOI
10.3760/j.issn:1003-9406.2007.01.015
发布时间
2007-04-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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