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江浙沪地区EV71的分子流行病学特征

Molecular epidemiological characteristics of EV71 in Jiangsu ,Zhejiang and Shanghai

摘要目的 研究江浙沪地区EV71-VP1遗传变异特征,了解江浙沪地区EV71病毒基因突变及抗原变异规律,为EV71的预防、治疗提供帮助.方法 从GenBank上下载了江浙沪地区2009-2014年共79株EV71的VP1区段序列与各亚型参考株序列,用MEGA7.0软件构建进化树,分析江浙沪地区EV71-VP1分子流行病学特征;用疫苗株FY23株做为参考株比较江浙沪地区EV71毒株的氨基酸变异情况.结果 通过进化树与序列同源分析,发现79株毒株均为C4a亚型,江浙沪地区EV71毒株可分为两个大簇与数个小簇,两个大簇间没有发现明显的序列差异,江浙沪三个地区的毒株在进化树上的分布不存在明显的差异.79株毒株共存在34个氨基酸位点突变,其中与病毒致病及疫苗接种效果相关的98、145、289位点发生多株突变,7株发生了病毒与受体结合相关的E145G/Q突变,7株发生了位于病毒表面BC环内的E98K突变,5株发生了与临床症状表现相关的A289T/V突变,未发现2009-2014年有明显的EV71毒株氨基酸变异差异.结论 虽然2009-2014年江浙沪地区的EV71毒株流行亚型没有改变,也不存在明显地区间的流行差异,但是病毒的基因及氨基酸突变较为多见,仍应关注该地区的病毒基因及抗原变异,以便更好的预防EV71疫情.

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作者 徐莉 [1] 王磊 [2] 崔大伟 [3] 戴玉柱 [4] 杨先知 [1] 谢国良 [1] 郑书发 [1] 陈瑜 [1] 学术成果认领
作者单位 [1] 浙江大学医学院附属第一检验科,浙江杭州,310003 [2] 浙江省临床体外诊断技术研究重点实验室,浙江杭州,310003 [3] 中国人民解放军第117医院检验科,浙江杭州,310016 [4]
分类号 R373
栏目名称 论著
DOI 10.11816/cn.ni.2017-170709
发布时间 2017-11-10
基金项目
"十二五"国家科技重大专项基金资助项目
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中华医院感染学杂志

中华医院感染学杂志

2017年27卷19期

4321-4324页

ISTICPKUCSCDCA

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