1株黄褐假单胞菌的分离鉴定及其系统进化分析
Isolation and identification of one strain of Pseudomonas fulva and phylogenetic analysis
摘要目的 对一株多药耐药黄褐假单胞菌株进行全基因组测序分析,解析其基因组特征及其在系统进化中的意义.方法 黄褐假单胞菌NY4814分离自2014年解放军总医院,经分纯保种和全基因组测序后,获得其基因组全序数据.通过平均核苷酸一致性(ANI)比对核定菌种;使用VITEK 2仪器测定菌株的最小抑菌浓度(MIC)值.从国家生物技术信息中心(NCBI)的RefSeq数据库下载所有黄褐假单胞菌基因组序列构建系统进化树.结果 黄褐假单胞菌NY4814对碳青霉烯类、喹诺酮类等抗菌药物耐药.染色体上携带一个新发现的Tn7675转座子,该转座子可介导氨基糖苷类和氯霉素类等抗菌药物耐药性.质粒pNY4814-IMP通过高度保守的接合转移机制驱动了blaIMP耐药基因在假单胞菌属内的广泛传播,其携带Tn6485i转座子,该转座子介导对β-内酰胺类抗菌药物耐药性.结论 黄褐假单胞菌是当前碳青霉烯类及其他种类耐药基因传播的潜在载体之一,正作为少数机会致病菌引起人类的感染,本研究通过分析NY4814的基因结构和其在种群中遗传进化关系,从而增加对此菌种的认识,为预防和监控细菌感染提供理论依据.
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