换一批MALDI-TOF MS与PFGE在铜绿假单胞菌分型与传播链分析中的应用
Application of MALDI-TOF MS and PFGE in typing and transmission chain Pseudomonas aeruginosa
摘要目的 比较基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)与脉冲场凝胶电泳(PFGE)在铜绿假单胞菌分型与传播链分析中的应用.方法 本研究收集广州医科大学附属第五医院ICU分离的16株铜绿假单胞菌,对其进行药物敏感性试验,采用PFGE进行分型,并利用MALDI-TOF MS进行蛋白质谱分析.质谱数据分别通过MALDI Biotyper和Mass-Up进行处理,并计算辛普森多样性指数(SDI)、调整兰德指数(ARI)和华莱士系数(AW),以评估MALDI-TOF MS与PFGE结果的一致性.此外,基于PFGE分型结合菌株的ICU床位分布及采样时间,评估ICU内该菌的潜在传播模式.结果 PFGE将16株铜绿假单胞菌划分为 12型,而 MALDI Biotyper和 Mass-Up处理的质谱数据分别分为 10型和11型.SDI计算结果显示,MALDI Biotyper和Mass-Up处理的数据多样性较低(SDI值分别为 0.925和0.875),均未达到PFGE(0.975)的分辨水平.ARI(MALDI Biotyper VS PFGE)值为 0.134,而ARI(Mass-Up VS PFGE)值仅为 0.072,二者与PFGE的一致性均较低,分型结果与PFGE差异较大.在分型推导能力方面,AW(MALDI Biotyper→PFGE)值为 0.088,优于 Mass-Up,但仍难以复现 PFGE的分型模式.结论 MALDI-TOF MS的分型能力低于PFGE,且在菌株传播链的复现方面存在局限.经MALDI Biotyper处理的数据能提供有限参考,但经Mass-Up处理的数据稳定性不足.
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关键词
铜绿假单胞菌基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱脉冲场凝胶电泳同源性分析传播链分析医院获得性感染Pseudomonas aeruginosaMatrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometryPulsed-field gel electrophoresisHomology analysisTransmission chain analysisHospital-acquired infection
栏目名称
DOI
10.11816/cn.ni.2026-252183
发布时间
2026-03-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
广东省基础与应用基础研究基金（2021A1515011081）
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