换一批西安地区3株产二元毒素ST5型艰难梭菌基因组特征
Genomic characteristics of 3 strains of binary toxin-producing Clostridium difficile ST5 in Xi'an
摘要目的 了解西安地区产二元毒素艰难梭菌的耐药基因、毒力基因和移动遗传元件的分子特征.方法 应用二代和三代测序仪对临床分离的3株ST5艰难梭菌(CD2019008、CD2022013和CD2023025)进行测序,使用Prokka软件对测序结果进行注释,Easyfig软件对PaLoc和CdtLoc区域的序列进行分析,Abricate软件预测耐药基因和毒力基因,E-test药敏条检测3株艰难梭菌的药物敏感性,使用ICEscreen、ISEScan、PlasmidFinder和噬菌体搜索工具来分析移动遗传元件.结果 3株艰难梭菌基因组大小范围4.07～4.15 Mbp,与RT027/ST1和RT078/ST11菌株相比,3株ST5菌株携带的PaLoc区域更大且插入了Tn6218转座元件,编码了截短的TcdC蛋白.同时含有完整的二元毒素编码及调控基因,这些基因与RT027/ST1菌株具有高度同源性.除携带有tcdA、tcdB和cdtA/B毒素基因,还携带有6个细胞黏附基因、1个胞外酶基因和5个耐药基因,3株艰难梭菌对环丙沙星均耐药,菌株CD2019008对左氧氟沙星耐药,对其余药物均敏感.2株艰难梭菌鉴定出了ICEs和IMEs,插入序列IS优势家族为IS200/IS605.结论 通过对3株产二元毒素艰难梭菌的全基因组特征分析,并与流行株027和078型进行比较,本研究揭示了ST5型菌株的毒力与耐药基因谱、移动遗传元件特征及其特有的转座子Tn6218.该菌株具备成为高毒力优势流行株的潜力,应加强对ST5型艰难梭菌的监测与研究.
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关键词
ST5艰难梭菌二元毒素全基因组测序移动遗传元件西安ST5 Clostridium difficileBinary toxinWhole genome sequencingMobile genetic elementXi'an
栏目名称
DOI
10.11816/cn.ni.2026-252773
发布时间
2026-06-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
西安市创新能力强基计划-医学研究项目（21YXYJ0080）
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