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低盐饮食对犬类心脏组织基因表达的影响

Effects of low salt diet on gene expression in dog's heart

摘要目的:探讨低盐饮食对哺乳动物心脏组织基因表达谱的影响,并分析差异表达基因可能涉及的分子生物学功能.方法:从基因芯片公共数据库(GEO)中获取低盐饮食心脏组织基因芯片数据(GSE17149),将数据导入Qlucore OmicsExplorer 3.1、STRING 10.0、Genclip 2.0、GCBI 等分析软件,筛选低盐饮食组与正常饮食组实验动物心脏组织差异表达基因,并分析差异表达基因编码蛋白质相互作用网络等,筛选两组之间的关键节点基因.结果:与正常饮食组比较,低盐饮食组犬心脏组织基因表达谱发生改变,在43 035 个基因中共有1343 个(3.12%)差异表达基因;差异表达基因蛋白质相互作用网络分析发现1 个最明显的蛋白质互相作用网络,以NF-κB 抑制因子-α(NFKBIA)蛋白为核心,主要发挥减弱巨噬细胞源性泡沫细胞分化、促进胆固醇排出和分解等生物学功能.结论:低盐饮食动物心脏组织基因转录谱发生明显改变,低盐饮食可能通过上调NFKBIA 基因的表达来降低心血管疾病的风险.

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浙江大学学报(医学版)

浙江大学学报(医学版)

2017年46卷4期

433-438页

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