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Scaling behavior of nucleotide cluster in DNA sequences

摘要In this paper we study the scaling behavior of nucleotide cluster in 11 chromosomes of Encephalitozoon cuniculi Genome. The statistical distribution of nucleotide clusters for 11 chromosomes is characterized by the scaling behavior of P(S) ∝e-as,where S represents nucleotide cluster size.The cluster-size distribution P(S1+S2)with the total size of sequential C-G cluster and A-T cluster S1+S2 were also studied. P(S1+S2) follows exponential decay. There does not exist the case of large C-G cluster following large A-T cluster or large A-T cluster following large C-G cluster. We also discuss the relatively random walk length function L(n) and the local compositional complexity of nucleotide sequences based on a new model. These investigations may provide some insight into nucleotide cluster of DNA sequence.

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作者单位 Department of Physics, Jinhua College of Profession and Technology, Jinhua 321017, China [1] Department of Physics, Wenzhou University, Wenzhou 325027, China [2]
栏目名称
发布时间 2007-06-04(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
基金项目
国家自然科学基金(20574052) 新世纪杰出人才项目(R404047;Y405011)
提交
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浙江大学学报B(英文版)

浙江大学学报B(英文版)

2007年8卷5期

359-364页

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