SMN2基因甲基化与中国儿童型脊肌萎缩症疾病严重程度的相关分析

Association betweenSMN2 methylation and disease severity in Chinese children with spinal muscular atrophy

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摘要目的：分析我国脊肌萎缩症（SMA）患儿SMN2基因甲基化水平与其转录水平，并初步探讨该基因的甲基化修饰是否影响我国儿童型SMA疾病的严重程度。<br>　　创新点：首次在中国儿童型 SMA人群中分析 SMN2基因甲基化状态，提示该基因的甲基化模式在不同人种间具有一定保守性，而甲基化单元的甲基化状态可能具有种族差异。本研究也初步提示 SMN2基因甲基化水平除了可能影响该基因的转录，还可能影响基因的可变剪接。<br>　　方法：应用 MassARRAY的方法检测35例 SMA患儿（SMN1基因纯合缺失，SMN2基因3拷贝）外周血细胞中SMN2基因甲基化状态；应用实时聚合酶链反应（real-time PCR）的方法检测SMN2基因不同转录本的表达水平；分析SMN2基因甲基化与该基因的转录以及SMA疾病严重程度的关系。<br>　　结论：位于甲基化岛1的两个甲基化单元（nt ?871和nt?735）和位于甲基化岛4的nt +999甲基化单元的甲基化水平在III型患儿中显著低于II型和I型患儿；nt?871和nt?290/?288/?285甲基化单元的甲基化水平与 SMN2基因全长转录本（SMN2-fl）的转录水平呈负相关。此外，nt +938甲基化单元的甲基化水平与 SMN2基因全长转录本与跳跃外显子7转录本的比值（fl/D7）呈负相关，但与SMN2的转录水平无关。因此，我们初步得出 SMN2基因甲基化可能通过调控其转录而影响我国儿童型SMA的疾病表型。