Comparative genomic analysis ofLactobacillus plantarum ZJ316 reveals its genetic adaptation and potential probiotic profiles

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摘要题目：比较基因组学揭示植物乳杆菌ZJ316的生境适应性及潜在益生特性目的：前期研究发现植物乳杆菌ZJ316能显著抑制病原菌，促进仔猪生长，提高猪肉质量等，本研究拟在ZJ316全基因组测序的基础上，运用比较基因组学手段揭示与其生境适应性及益生特性相关基因。创新点：首次从基因水平上分析与植物乳杆菌ZJ316的生境适应性、抑菌活性及益生特性等相关的基因，为进一步揭示其生理功能打下基础。方法：运用BLASTN、Mauve和MUMmer等将植物乳杆菌ZJ316全基因组序列与已测序的8个植物乳杆菌全基因组序列进行比对及分析；用CRISPRFinder寻找CRISPR重复序列。结论：植物乳杆菌ZJ316包含碳水化合物的运输和代谢、蛋白水解酶系统和氨基酸的生物合成等相关基因，具有CRISPR、应激反应、耐胆盐、粘附宿主肠壁、胞外多糖、生物合成和细菌素生物合成等相关基因。这些基因的功能是其作为益生菌的重要特征和基础。

作者单位 Key Laboratory for Food Microbial Technology of Zhejiang Province, College of Food Science and Biotechnology, Zhejiang Gongshang University, Hangzhou 310018, China ^[1]

关键词植物乳杆菌 ZJ316 比较基因组学益生菌适应性 Lactobacilus plantarum ZJ316 Comparative genomics Probiotics Adaptation

主题词植物(Plants)乳(Milk)性(Sex)基因组学(Genomics)基因(Genes)

发布时间 2016-08-17

基金项目

the International Science & Technology Coop-eration Program of China the National Natural Science Foundation of China the National High-Tech R & D Program (863) of China the Natural Science Foundation of Zhejiang Province China

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