基于全基因组可变剪接谱解析电针抗心肌缺血再灌注损伤的新机制
Genome-wide analysis of electroacupuncture in restoring splicing regulation after myocardial ischemia-reperfusion injury
摘要[背景]前体mRNA选择性剪接(AS)是一种重要的转录后调控机制.基因的异常剪接可导致心血管疾病.针灸已被证明可缓解心肌缺血再灌注损伤(MIRI),但大多数研究集中于针灸对基因表达的调控.我们先前报道过电针(EA)可通过调控GABARG2基因的AS来缓解心绞痛,但EA在全基因组范围内对AS的调控作用尚不清楚.[方法]研究探讨了EA对MIRI的保护作用.随后,研究了从基因表达综合数据库(GEO)获取的AS谱,并使用重复多元转录本剪接分析(rMATS)工具对数据进行分析.接着,对通过生物信息学分析鉴定出的、受EA调控的剪接调控因子及其靶基因进行了验证实验.[结果]研究显示,在内关穴(PC6)施加EA能有效缓解MIRI.MIRI发生后,有200多个差异性可变剪接事件(ASEs)发生了改变.对这些差异性ASEs进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析、基因本体论(GO)富集和通路分析,表明它们参与了不同的生物学功能,尤其是在突触结构的维持方面.富集分析还鉴定了几个可能与MIRI进展相关的通路.重要的是,发现了可被EA治疗完全挽救的关键ASEs和通路.在验证实验中发现,与突触功能相关的关键基因CAMK2G的AS,受到EA调控的MBNL1蛋白表达水平的调节.[结论]研究表明,EA不仅通过挽救基因表达来有效保护机体免受MIRI的伤害,还能挽救异常的ASEs.本研究是对EA在MIRI中调控AS的全基因组综合性分析的一项重要贡献.
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