鲤JAK2基因分子克隆及组织表达分析

Cloning and Expression Analysis of JAK2 Gene in Common Carp, Cyprinus carpio

二维码有效期 120s

摘要采用同源克隆策略和RACE-PCR技术，克隆得到可能的鲤（Cyprinus carpio）两面神激酶2（JAK2）基因的cDNA全长序列，包括3378 bp的开放阅读框，732 bp的5'-非编码区，529 bp的3'-非编码区，总长度达4639 bp。开放阅读框可编码1125个氨基酸，推测分子质量和理论等电点分别为129.33 ku和6.99。同源性分析显示，克隆的鲤鱼基因与斑马鱼（Danio rerio）JAK2同源性最高，其氨基酸序列同一性和相似度分别达89%和95%。结构域预测表明，所编码氨基酸序列包含FERM、SH2及两个酪氨酸激酶结构域，这4个结构域也保守地存在于其他脊椎动物的JAK分子中。高级结构预测显示，鲤JAK2主要包括α-螺旋（α-helix）、β-折叠（β-sheet）和连接环（loop）等3类结构元件。脊椎动物JAK分子系统进化树显示，JAK1、JAK2、JAK3和TYK2等4类JAK分子分别聚类，鲤JAK2处于JAK2支系中，与所有其他的鱼类JAK2聚为一大支，并与两栖类和哺乳类组成的另一大支构成姊妹群，表明它们具有共同的祖先基因，为直系同源关系。实时荧光定量PCR检测结果表明，鲤JAK2在皮肤中表达量最高，其次是肠、血液和脑，而在肌肉、鳃、头肾、心、肝、脾中表达量较低；鲤JAK3在脾中表达量最高，在其他组织中表达量均很低，甚至未检出。