摘要目的 应用网络药理学、转录组学及计算模拟技术探究银杏叶抗慢性心力衰竭的作用机制.方法 通过TCMSP数据库、SwissTargetPrediction数据库进行银杏叶的主要活性成分筛选及靶点预测;通过GeneCards、OMIM、TTD、Drugbank数据库检索获取慢性心衰的潜在靶点.利用维恩图得到银杏叶与慢性心衰的交集靶点,导入STRING数据库建构PPI网络,应用Cytoscape3.10.3软件对蛋白互作网络进行拓扑学分析筛选出银杏叶抗慢性心衰的关键靶点.采用DAVID数据库对交集靶点进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.通过GEO数据库下载GSE84796芯片表达矩阵,采用差异表达基因分析关键靶点.应用AutoDock软件对GEO数据库分析得到的核心靶点与其对应化合物进行分子对接.对结合能最低的构象进行分子动力学模拟评估复合物的结合稳定性.结果 获得银杏叶10个活性成分和74个与慢性心衰的交集靶点,通过拓扑学分析获得度值排名前5的关键靶点为ESR1、MMP9、PPARG、AKT1、HIF1A.GO分析表明银杏叶抗慢性心衰的潜在靶点生物学功能主要涉及蛋白质磷酸化、PI3K-AKT信号转导调控及凋亡信号通路调节等,细胞组分富集于质膜、细胞质及细胞质核周区等区域,分子功能主要与蛋白酪氨酸激酶活性、激酶活性及蛋白激酶活性等有关,KEGG通路富集分析表明银杏叶抗慢性心衰的通路涉及PI3K-Akt信号通路、Rap1信号通路、Ras信号通路等多条信号通路.通过GEO数据库分析得到核心靶点为MMP9、ESR1,分子对接结果显示银杏叶活性成分与MMP9、ESR1均具有较强的结合活性,其中香叶木素与MMP9的结合活性最显著.分子动力学模拟进一步验证了香叶木素与MMP9的结合具有较好的结构稳定性.结论 银杏叶可通过多组分、多靶点、多通路发挥抗心肌重构等作用进而治疗慢性心力衰竭.
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