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碳青霉烯耐药肠杆菌目细菌的流行分布和耐药特征分析

摘要目的 分析碳青霉烯耐药肠杆菌目细菌(CRE)的临床分布及其耐药表型.方法 收集本院分离的CRE菌株,采用MALDI-TOF MS进行菌种鉴定,Vitek Ⅱ Compact系统进行常规药敏试验;多黏菌素最小抑菌浓度(MIC)通过微量肉汤稀释法测定;替加环素和头孢他啶-阿维巴坦采用纸片扩散法检测.碳青霉烯酶表型鉴定通过抑制剂增强实验完成,基因型通过PCR检测.对同时产两种碳青霉烯酶的菌株,联合使用Illumina二代测序和Nanopore三代测序进行基因组分析.结果 共检出157株CRE,其中肺炎克雷伯菌(CRKP)106株、大肠杆菌(CRECO)22株、阴沟肠杆菌(CRECL)17株,其余为产酸克雷伯菌等9种菌株.CRE对阿米卡星和复方新诺明的耐药率分别为40.00%和56.69%,对其余常用抗生素耐药率普遍较高;对多黏菌素、替加环素和头孢他啶-阿维巴坦的耐药率较低,分别为4.49%、8.28%和34.19%.碳青霉烯酶检测显示:产丝氨酸酶98株,产金属酶46株,同时产两种酶类7株,未确定酶型6株.PCR结果显示,CRKP主要携带blaKPC,CRECO和CRECL主要携带blaNDM.进一步分析表明,产KPC菌株对多黏菌素、替加环素和头孢他啶-阿维巴坦的敏感率分别为93.88%、87.76%和98.96%;产NDM菌株对多黏菌素和替加环素的敏感率较高(分别为97.78%和97.83%),但对头孢他啶-阿维巴坦的敏感率仅4.35%.头孢他啶-阿维巴坦的敏感率与CRE菌种及碳青霉烯酶类型相关(P<0.05).一株同时携带blaKPC与blaNDM的菌株中,两基因分别位于IncFII型和IncX3型质粒上.结论 本研究CRE以产KPC的CRKP为主,其次为产NDM的CRECO和CRECL.CRE对多黏菌素和替加环素普遍敏感,而对头孢他啶-阿维巴坦的敏感性受菌种及碳青霉烯酶类型影响.

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