换一批
换一批大白菜WRKY转录因子的全基因组鉴定与分析
Genome-wide identification and analysis of WRKY transcription factors in Chinese cabbage
摘要WRKY转录因子是一类重要的调控分子,在高等植物中以基因家族的形式存在.试验以大白菜基因组数据为材料,利用生物信息学手段对WRKY转录因子进行了全基因组鉴定与分析.结果表明,大白菜至少有134个WRKY转录因子,蛋白序列长度为143～1 082;基因组DNA全长880 ～9 099 bp,具1～15个内含子.染色体定位结果表明,10条染色体上均有WRKY转录因子基因的分布,A3染色体上最多(26),A10染色体分布最少(4).大白菜WRKY转录因子可分为3大类,Ⅰ类、Ⅱ类和Ⅲ类的数量分别为27,83和24,它们处于进化树的不同分支.除保守的WRKYGQK和常见变异序列WRKYGKK外,新发现WRKDGQK,WRKNGQK和WMKYGQK等3种WRKY结构域类型.
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栏目名称
园艺科学
DOI
10.3969/j.issn.1004-1524.2013.05.13
发布时间
2014-01-03
基金项目
浙江省公益性技术应用研究计划项目
台州市科技计划资助项目
浙江省自然科学基金项目
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