换一批
换一批子痫前期患者内含子多聚腺苷酸化VEGFA-VEGFR2信号通路的富集分析
Genes in VEGFA-VEGFR2 signaling pathway enriched in pre-eclampsia-related intronic polyadenylation
摘要目的 分析与子痫前期(PE)相关的转录组内含子多聚腺苷酸化(IPA)现象.方法 从GEO数据库中收集到90例PE相关样本的转录组数据.采用STAR比对到人类基因组hg38,利用IPAFinder软件分析比对文件中的IPA现象.Miranda软件进行miRNA靶基因预测.差异表达基因的评估使用edgeR与对数倍数变化＞1和调整的P＜0.05,通过Clusterprofiler进行功能富集分析.结果 血管内皮生长因子A(VEGFA)-血管内皮生长因子受体2(VEGFR2)信号通路中的基因在PE相关的IPA现象中出现富集,且VEGFA-VEGFR2通路中基因表达水平与IPA现象呈负相关.鉴定出LIN28B和AGO2是与IPA位点结合最显著的基序.分析与这些IPA现象相关的miRNA结合位点,发现miR-193b和miR-365a在IPA基因中起核心调控作用.结论 VEGFA-VEGFR2信号通路可能通过IPA改变影响PE的发病,子痫前期中IPA相关miRNA和基因表达变化之间有潜在的临床相关联系.
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关键词
子痫前期转录组内含子多聚腺苷酸化VEGFA-VEGFR2信号通路Pre-eclampsiaTranscriptomeIntronic polyadenylationVEGFA-VEGFR2 signaling pathway
栏目名称
临床研究
DOI
10.12056/j.issn.1006-2785.2024.46.20.2024-1328
发布时间
2024-11-28
基金项目
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