摘要目的 通过基于RNA聚合酶(RNAP)Ⅱ相关基因集的多组学整合分析,确定结肠癌(CRC)预后分子亚型.方法 利用MSigDB、肿瘤全基因图谱、基因表达综合数据库下载数据集,确定CRC分子亚型以及聚类数目,采用生物信息学手段进行基因富集、体细胞突变、免疫细胞浸润以及CRC患者含1A的核前体mRNA结构域的调控蛋白(RPRD1A)表达与预后关系的分析.以野生型SW480细胞为对照(对照组),经慢病毒质粒系统处理构建稳定过表达RPRD1A的SW480细胞(过表达组),经短发夹状双链RNA处理构建敲低RPRD1A的SW480细胞(敲低组),采用细胞计数试剂盒-8、细胞克隆形成实验分别检测细胞活力和克隆形成数量.结果 CRC预后分子亚型分析中最适宜的聚类数目为3.3个亚组间有24条信号通路存在明显差异;亚组中体细胞突变率最高的基因是TP53、APC.3个亚组间体细胞突变模式存在一定的相似性和明显差异,免疫相关基因CD274、PDCD1、CTLA4、LMTK3、PIM3、LAG3、TIGIT、IDO1、HAVCR2、TNFRSF4 和 RNAP Ⅱ 相关基因 RPRD1A、TP53、RPRD1B、POLR2J、FOXP3等表达均存在明显差异.CRC组织中RPRD1AmRNA相对表达量明显高于配对的正常组织,且随着CRC分期的增加而呈下降趋势;RPRD1A高表达组患者总体生存率明显高于RPRD1A低表达组.与对照组比较,过表达组RPRD1AmRNA相对表达量较高,细胞活力较低,细胞克隆形成数量较少,差异均有统计学意义(均P＜0.01).与对照组比较,敲低组RPRD1AmRNA相对表达量较低,细胞活力较高,细胞克隆形成数量较多,差异均有统计学意义(均P＜0.05).结论 基于RNAP Ⅱ相关基因集确定CRC3个分子亚组,各组间分子亚型存在明显差异,且细胞实验证实RPRD1A能显著抑制CRC细胞增殖.