网络药理学与分子对接技术融入实验方剂学教学设计的探索
Exploration of Integrating Network Pharmacology and Molecular Docking Technology into the Teaching Design of Experimental Traditional Chinese Medical Formulae:A Case Study of Toxicity Reducing and Efficacy Enhancing of Compatibility Dosage by Sini Decoction
摘要[目的]将网络药理学与分子对接技术融入实验教学设计与实践,帮助本科生构建从分子水平到整体疗效的学习路径,深化对方剂机制的理解.[方法]以四逆汤组方配伍减毒增效为例,通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)、Cytoscape 3.9.0 软件构建网络,运用基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析、分子对接等手段开展教学,并在教学中以实验预习、实验模拟以及团队协作能力培养为抓手,引导学生自主设计并完善验证性实验,最终依据线上操作和线下实验报告考核,完成过程和结果评价,及时做好教学反馈.[结果]通过收集四逆汤118个活性成分与364个共有靶点,学生可作图分析出丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(serine/threonine-protein kinase 1,AKT1)和白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)等核心靶点与相应信号通路,并经分子对接获得可视化数据.与传统教学相比,实验教学班级期末得分率较高,学习成果显著.[结论]网络药理学与分子对接技术在方剂学课程中的应用,有助于学生理解方剂的作用机制及疗效,有效提升方剂学的教学质量.
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