LINC01614对肺癌A549细胞的转录组影响以及耐药相关性的研究

Transcriptomic Effects of LINC01614 on Lung Cancer A549 Cells and Relevance of Drug Resistance

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摘要目的研究LINC01614在非小细胞肺癌A549细胞中的生物学作用及其耐药相关机制.方法采用CRISPR/Cas9技术构建敲除LINC01614的A549细胞模型.对敲除LINC01614的A549细胞进行转录组测序.对转录组差异基因MCAM和ABCC3进行基因水平的验证.对化疗耐药相关基因MCAM进行蛋白水平的验证.检测不同浓度顺铂作用下,敲除LINC01614后的A549细胞IC50变化.检测敲除LINC01614对A549细胞迁移能力的影响.结果差异基因表达分析结果显示,敲除LINC01614后,共得到2713个DEGs,其中上调基因1626个,下调基因1087个.GO分析结果显示,DEGs与细胞内信号转导、细胞黏附等有关.KEGG分析结果显示,DEGs与Wnt信号通路、TGF-β信号通路以及Rap1信号转导途径等有关.从DEGs中选择耐药相关基因ABCC3与MCAM进行验证,qRT-PCR结果显示,敲除LINC01614后,MCAM在A549细胞上的表达显著下调(P＜0.05),ABCC3在A549细胞上的表达显著上调(P＜0.05).敲除LINC01614后,A549细胞中化疗耐药相关基因MCAM的蛋白表达量显著下降(P＜0.05);A549细胞对顺铂的IC50显著上升(P＜0.05);A549细胞的划痕愈合率显著降低(P＜0.05).结论 LINC01614可能与A549细胞的增殖、侵袭以及凋亡通路有关.LINC01614可能通过MCAM来发挥其自身的迁移能力以及对顺铂的化疗耐药性.

作者白钰明 ^[1] 李金 ^[2] 施琳 ^[3] 贾永峰 ^[3] 刘霞 ^[3] 云芬 ^[3] 学术成果认领

作者单位 010000 呼和浩特,内蒙古医科大学基础医学院 ^[1] 010000 呼和浩特,内蒙古医科大学基础医学院;028000 通辽,通辽市科尔沁区第一人民医院病理科 ^[2] 010000 呼和浩特,内蒙古医科大学基础医学院;010000 呼和浩特,内蒙古医科大学附属医院病理科 ^[3]

关键词 LINC01614 非小细胞肺癌转录组测序顺铂耐药性

分类号 R734.2

栏目名称

基础研究

DOI 10.3971/j.issn.1000-8578.2023.22.0293

发布时间 2023-07-05

基金项目

内蒙古自治区自然科学基金项目（2018MS08094）