COL5A1基因在肿瘤预后和免疫浸润中作用的泛癌分析
Pan-Cancer Analysis of COL5A1 Expression and Its Biological and Clinical Implication
摘要[目的]分析泛癌中的COL5A1基因及蛋白表达水平,并探讨其与临床预后和肿瘤免疫浸润的关系.[方法]分析癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中肿瘤患者的数据,采用 TIMER2.0、GEPIA2、SangerBox、人类蛋白图谱(human protein atlas,HPA)和STRING分析等生物信息学工具分析COL5A1基因与泛癌的关系.[结果]COL5A1在17种不同肿瘤和癌旁组织中的表达水平有差异.COL5A1高表达与膀胱尿路上皮癌、肺鳞状细胞癌、肺腺癌、宫颈鳞状细胞癌和宫颈腺癌、甲状腺癌、卵巢癌、肾透明细胞癌、肾乳头状细胞癌和胃腺癌总生存期相关(P均<0.05).COL5A1表达与肿瘤微环境免疫检查点、肿瘤突变负荷和微卫星不稳定性显著性相关.COL5A1表达与B细胞、T细胞、中性粒细胞、巨噬细胞和抗原递呈细胞相关.[结论]COL5A1是肿瘤微环境的重要组成部分,影响免疫细胞浸润,可作为评估多种恶性肿瘤的免疫浸润和预后分析的肿瘤标志物.
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