换一批磷酸二酯酶4B专一性抑制剂设计中的构象分析
Conformation analysis in the design of phosphodiesterase 4B selectivity inhibitors
摘要为研究磷酸二酯酶4(PDE4)抑制剂Y3、Y8及A33的结构与活性之间的关系,寻找Y3和Y8抑制活性偏低的原因.采用分子对接、构象搜索、量子力学计算、分子动力学以及分子力学-广义波恩及表面积连续介质模型进行了计算.结果表明:Y3、Y8及A33与PDE4亚型PDE4B和PDE4D的结合模式类似,亲和能相近.但Y3与Y8与PDE4B/PDE4D的结合构象以及A33与PDE4D的结合构象均为高能构象,而A33与PDE4B的结合构象为低能构象.故结合构象内能过高是这些配体抑制活性降低的主要原因,构象分析对药物分子设计至关重要.
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栏目名称
DOI
10.20056/j.cnki.ZNMDZK.20230202
发布时间
2023-03-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（21273089）
中央高校基本科研业务费专项资金资助项目（CZY20020）
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