广州地区HCMV临床病毒株UL137基因的结构特征与多态性

Characterization of Human Cytomegalovirus (HCMV) UL137 Gene in Low-passage Clinical Isolates in Guangzhou

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摘要[目的]研究广州地区新生儿感染人巨细胞病毒(HCMV)临床低传代分离株UL137基因的结构特征与基因多态性.[方法]从62份被证实为临床HCMV感染的新生儿尿液标本中分离获得3株低传代临床病毒株,经多重PCR鉴定后分别命名为HCMV D2、D3和D52.对3株临床分离株进行HCMV UL137基因全序列PCR扩增,PCR产物纯化后进行基因克隆,构建HCMV UL137-pMD18-T重组质粒;基因测序;将HCMV UL137基因序列呈报GenBank,并进行基因生物信息学分析.[结果]成功从广州地区新生儿感染HCMV患儿体内分离3株HCMV临床病毒株.克隆测序后呈报GenBank并被收录,收录序列号分别为:DQ180388、DQ180376、DQ180360.通过序列分析,结果显示低传代分离株UL137基因DNA序列高度保守,同源性在96.91%～100%之间.其变异均为碱基替换;编码蛋白均由96个氨基酸残基组成,同源性在90.63%～100%之间,超半数的变异发生在第61～81位氨基酸残基之间;编码蛋白翻译后修饰位点包括PKS、MYS、cAMPs三类,其中4个PKS和44～49位的MYS高度保守,cAMPs位点仅在5株病毒出现;编码蛋白等电点在11.50～12.00之间,呈强碱性.[结论]广州地区临床低传代分离株HCMV UL137基因核苷酸序列及其编码蛋白的氨基酸序列极为保守,但仍存在一定多态性.提示HCMV UL137 ORF可能是一个具有重要功能的基因.