换一批SNP基因芯片结合多重置换扩增技术检测单细胞非整倍体的研究
Detection of Aneuploidy from Single Cells by Array-Comparative Genetic Hybridization
摘要[目的] 建立并优化利用微阵列-比较基因组杂交技术检测单细胞非整倍体的实验方案. [方法] 纤维母细胞系GM02732(47,XY,+18)和GM00343[46,XY,4(del) (qter ＞ p14)]被用于实验.阳性对照组为上述细胞系的基因组DNA(gDNA)(A组与B组,n ＝ 6);实验组为单细胞模板的多重置换扩增(MDA)产物(C组与D组,n ＝ 10);阴性对照组为空白对照的MDA产物(E组,n ＝ 6).以上样本与10 k 2.0基因分型芯片杂交并进行染色体拷贝数分析,比较利用非扩增的正常gDNA和同法扩增的DNA(MDA-DNA)作为分析参照对C组和D组的结果准确度的影响.[结果] A→E组的芯片杂交信号判读率分别为98.7%、97.2%、86.7%、85.9%与3.2%.利用单细胞MDA-DNA作为参照时,C组与D组杂交信号的变异程度明显小于使用gDNA作为参照时(P ＜ 0.05).利用CNAT分析软件,发现以gDNA作为参照时,C组与D组部分染色体优势扩增明显,而使用MDA-DNA作为参照时则未观察到类似现象. [结论] 结合MDA和基因芯片平台对单细胞进行非整倍体检测时应使用同法扩增的DNA作为分析参照.
更多相关知识
关键词
SNP基因分型芯片多重置换扩增非整倍体筛查植入前遗传学诊断SNP mapping arraymultiple displacement amplificationaneuploidy screeningpreimplantation genetic diagnosis
分类号
R711.6（妇科学）
栏目名称
DOI
10.3321/j.issn:1672-3554.2009.04.024
发布时间
2009-08-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
- 浏览374
- 被引2
- 下载120
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
