换一批急性髓系白血病新型预后分子标志物NKX2-3的发现
Discovery of A New Prognostic Molecular Marker NKX2-3 for Acute Myeloid Leukemia
摘要[目的]通过分析生物信息数据库中影响急性髓系白血病(AML)患者的预后的分子标志物的表达,为进一步探索AML预后的新型分子标志物提供实验基础.[方法]从癌症基因组图谱(TCGA)生物信息数据库中的179例AML患者的预后数据进行差异性基因分析及生存分析;利用基因表达集锦(GEO)数据库中的GSE13159数据集的74例健康人(HI)骨髓标本与542例AML初发患者骨髓标本进行分析,检测差异性目的基因表达水平在AML初发患者与健康人中的差异性;收集初发18例AML患者的外周血及骨髓样本,同时收集年龄和性别匹配的20例健康志愿者的样本作为对照,采用实时荧光定量PCR验证差异基因在AML患者体内的表达水平.[结果]生物信息数据分析显示,根据R语言计算出的NK2转录因子相关基因位点3(NKX2-3)的最佳截断值0.051进行生存分析,发现与低表达NKX2-3的AML初发患者相比,高表达NKX2-3的AML初发患者总体生存率较差(P = 0.003 6);与HI相比,NKX2-3在AML初发组患者中显著高表达(P＜0.001);实时荧光定量PCR的验证结果也证实NKX2-3-1和NKX2-3-2在AML初发组患者中高表达,且与健康人组相比有显著相关性(P = 0.000,P = 0.000).[结论]NKX2-3在AML初发组患者中高表达,且高表达NKX2-3的AML患者总体生存较差;NKX2-3可能与AML临床转归与预后密切相关.
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关键词
急性髓系白血病NKX2-3生物信息学预后基因表达相关性acute myeloid leukemia(AML)NKX2-3bioinformaticsprognosisgene expressioncorrelation
分类号
R3（基础医学）
栏目名称
DOI
10.13471/j.cnki.j.sun.yat-sen.univ(med.sci).20240004.014
发布时间
2024-03-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（82170220）
广东省自然科学基金（2022A1515010313）
广东省自然科学基金（2020A1515010817）
广东省基础与应用基础研究基金青年提升项目（2023A1515030271）
广州市基础与应用基础研究一般项目（202201010164）
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